Cela implique notamment les missions principales suivantes :

• conduire les travaux de planification financière et de budgétisation;
• assurer le suivi et le respect des dispositions légales et règlementaires et de l'exécution des budgets dans le cadre arrêté par le Grand Conseil;
• gérer le cadre comptable en application du modèle harmonisé des cantons;
• examiner les dossiers à caractère financier;
• élaborer les prises de position dans le cadre de consultations fédérales ou cantonales;
• participer aux travaux de commissions ou groupes de travail divers.

La PFCB élabore également l'ensemble des statistiques financières relatives aux résultats comptables et budgétaires de l'Etat.