Placée sous la direction du Trésorier d'Etat, l'AFin est organisée comme suit :
| Domaines | Activités |
|---|---|
| Affaires financières | Secrétariat général de l’Afin, réception, courrier, administration interne, ressources humaines, examen à l'intention du Conseil d'Etat de l'incidence financière des projets, dossiers spécifiques (p. ex. RPT, PF 17) |
| Planification financière et contrôle budgétaire (Afin-PFCB) | Prévision, contrôle, analyse et conseil en matière de finances publiques |
| Comptabilité de l’Etat (Afin-Compta) | Paiements des factures adressées aux différents services de l’Etat et tenue de la comptabilité générale |
| Service financier cantonal (Afin-SFC) | Gestion des encaissements relatifs aux factures émises par les différents services de l’Etat (à l'exception des créances fiscales) et contentieux y relatif |
| Nouveaux instruments de gestion financière (Afin-Nigefi) | Déploiement du progiciel SAP dans les domaines financiers et logistiques |
| Instruments de gestion financière et gestion des subventions (Afin-SIGEFIS) | Gestion par prestations (GpP), réalisation des examens de subventions et suivi financier des participations de l’Etat de Fribourg |
| Logistique (Afin-Log) | Réception du bâtiment des finances (BAD), centrale téléphonique de l’Etat de Fribourg et gestion du courrier du BAD |
