Dirigée par la Chancelière d'Etat, Danielle Gagnaux-Morel, la Chancellerie d'Etat est organisée comme suit:
- Secrétariat du Conseil d'Etat
- Bureau de l'information
- Secteur Relations extérieures
- Secteur Traduction
- Secteur Administration
- Secteur Droits politiques
- Secteur Huissiers d'Etat
- Secteur Projets informatiques
- Archives de l'Etat de Fribourg AEF
- Service d'achat du matériel et des imprimés SAMI
- Service de législation SLeg
En outre, l'Autorité cantonale pour la transparence et la protection des données ATPrD ainsi que le médiateur cantonal lui sont rattachés administrativement.