Les bibliothèques affiliées sont les bibliothèques du canton dont les fonds sont inventoriés avec ceux de la BCU dans le catalogue Discovery Fribourg et dans le catalogue collectif Swisscovery.
A Fribourg, le prêt entre bibliothèques est centralisé. Toutes les demandes se font en ligne depuis le catalogue Discovery Fribourg. Les documents doivent être retirés à la BCU-Centrale.