L'hôpital fribourgeois est 1 hôpital sur 6 sites : Billens, Châtel-St-Denis, Fribourg-Freiburg, Meyriez-Murten, Riaz et Tafers, depuis le 1er janvier 2007 (loi).

La mission de chacun de ces sites est définie par la planification hospitalière établie par le Conseil d'Etat.

Le Conseil d'administration, nommé par le Conseil d’Etat, est responsable de la gestion de l’hôpital fribourgeois. Il organise les activités de l’hôpital fribourgeois en veillant à la mise en place de structures rationnelles et efficaces.

L'exploitation et la gestion de l'hôpital fribourgeois est confiée au directeur général, Hubert Schaller, désigné par le Conseil d'administration (direction). Il est assisté dans ses tâches par un Conseil de direction. 

Les structures de l'hôpital fribourgeois ont été définies par le Conseil d'administration en février 2007. L'organisation des structures médicales sont encore en voie d'élaboration (organigramme).