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La protection des biotopes ne suffit pas toujours à assurer la survie de certaines espèces plus exigeantes ou menacées. C’est pourquoi, il faut parfois mener une protection plus ciblée au niveau de l’espèce.

Le BPNP est responsable de la conservation de la plupart des espèces de la flore et de la faune fribourgeoise, sauf les espèces concernées par la Loi du 14 novembre 1996 sur la chasse et la protection des mammifères, des oiseaux sauvages et de leurs biotopes. Ces dernières sont du ressort du Service des forêts et de la faune.

Les listes rouges sont des instruments importants pour protéger efficacement les espèces.  Elles permettent de fixer des priorités dans les mesures de conservation.