Le Service de l'environnement (SEn) est chargé de l'application de la Loi fédérale sur la protection des eaux du 24 janvier 1991 (LEaux) et de la Loi fédérale sur la protection de l'environnement du 7 octobre 1983 (LPE). Créé en 1985 sur la base de l'office de la protection des eaux et disposant d'une quarantaine de collaborateurs, le SEn se compose de sept sections qui rassemblent la plupart des compétences en matière de protection des eaux et d'environnement.
 
Dans le but de préserver les ressources environnementales de notre canton, les tâches principales effectuées par les sections du SEn s’articulent autour de quatre mots-clés :
 
Observer
l'observation de la qualité de l'environnement sert de base aux actions de prévention et d'assainissement
 
Prévenir
chaque nouvelle activité ne doit pas entraîner de conséquences fâcheuses pour l'environnement
 
Assainir
les installations existantes provoquant des atteintes doivent être assainies
 
Informer
l'information de tout un chacun est primordiale pour arriver à faire modifier certains comportements à l'origine d'atteintes préjudiciables à l'environnement